Actualmente el manejo, control y protección de los recursos naturales en forma sostenible es una necesidad imprescindible dentro de las ASP.  La Herramienta para la evaluación de la efectividad de manejo de las ASP de Costa Rica (2013) subraya la necesidad de desarrollar Planes de Control y Protección que incluyan las medidas de control y prevención contra las amenazas reales o potenciales a la integridad de los elementos focales de manejo (EFM) de cada ASP, y asegure así su adecuada y eficiente conservación.

Presiones como el crecimiento demográfico, la expansión de la frontera agrícola, el empobrecimiento de ciertos sectores sociales, el desarrollo de infraestructura, y la tecnología han resultado en un incremento de la demanda de recursos naturales, han puesto en evidencia la seria amenaza que sufren nuestros ecosistemas, y han expandido la lista de especies en peligro de extinción.

Las AC a nivel regional y las ASP a nivel individual requieren realizar un análisis basado en su experiencia y criterio experto en el tema, para compilar y visualizar todas las acciones de control y protección a nivel macro, y realizar una mejor articulación de las mismas con miras a dar un “salto cuantitativo y cualitativo” en dicha temática.