La investigación ha sido una temática que debe ser atendida por el Estado y que en materia de diversidad biológica es competencia del Ministerio del Ambiente y Energía, a través del SINAC. El Programa Nacional de Investigación del SINAC cuenta desde el año 2000 con una Estrategia Nacional de Investigación sobre Biodiversidad y Recursos Culturales, la cual reúne las acciones prioritarias de investigación que deben ser abordadas en las Áreas de Conservación dentro y fuera de las áreas silvestres protegidas (ASP). Recientemente, en el año 2013 se revisó y actualizó esta Estrategia Nacional para además incorporar dentro de su alcance temas clave de investigación relacionados con el cambio climático e iniciativas tales como el Plan Estratégico del SINAC, el Plan Director de Áreas Protegidas y las políticas nacionales relacionadas.
Por otra parte, la Herramienta para la evaluación de la efectividad de manejo de las ASP de Costa Rica (2014) subraya necesidad de que éstas organicen sus prioridades y esfuerzos de investigación en la forma de un Plan que beneficie la gestión del área, y que a su vez responda a lo establecido en el Plan General de Manejo y a las estrategias regionales (Áreas de Conservación) establecidas.
