El último informe sobre el Estado de la Nación que incorpora el análisis de la conservación de la biodiversidad (2013) menciona que las principales amenazas o presiones sobre una mejora en las poblaciones de las especies, giran alrededor de la extracción de especies silvestres, la fragmentación del hábitat y el cambio en el uso de la tierra hacia prácticas intensivas.
Las causas inherentes de estas presiones incluyen: bajo nivel de conocimiento ambiental y valoración de los servicios ecosistémicos por las comunidades aledañas; permanencia de cultura de la cacería y mercado ilegal de las especies silvestres; continua migración de prácticas agrícolas diversificadas hacia otras más intensivas con especies introducidas; baja producción de especies nativas para el consumo que contribuya con el Plan Nacional de la Gastronomía Sostenible y Saludable para Costa Rica; atomización de recursos producen bajo impacto; el cambio climático.