La investigación ha sido una temática que debe ser atendida por el Estado y que en materia de diversidad biológica es competencia del Ministerio del Ambiente y Energía, a través del SINAC. El Programa Nacional de Investigación del SINAC cuenta desde el año 2000 con una Estrategia Nacional de Investigación sobre Biodiversidad y Recursos Culturales, la cual reúne las acciones prioritarias de investigación que deben ser abordadas en las Áreas de Conservación dentro y fuera de las ASP. En el año 2013 se revisó y actualizó esta Estrategia Nacional para además incorporar dentro de su alcance temas clave de investigación relacionados con el cambio climático e iniciativas tales como el Plan Estratégico del SINAC, el Plan Director de Áreas Protegidas y las políticas nacionales relacionadas.